王鐸是蕭遘科舉時(shí)的主考官，唐僖宗在蜀地時(shí)，二人同時(shí)拜相。一次，僖宗召見(jiàn)宰相，王鐸不慎跌倒，蕭遘從旁將他扶起。僖宗非常高興，道：“宰相和睦，是我的幸事啊。”又對(duì)蕭遘道：“你能尊重長(zhǎng)者，我很高興。”蕭遘答道：“臣扶王鐸不僅僅是尊重長(zhǎng)者，臣還是王鐸的門(mén)生。”僖宗笑道：“王鐸選進(jìn)士，朕選宰相，都沒(méi)有虧負(fù)卿啊。”

早年經(jīng)歷

　　咸通五年（864年），蕭遘考中進(jìn)士，被授為秘書(shū)省校書(shū)郎、太原從事，后升任右拾遺，累遷至起居舍人。咸通十三年（872年），韋保衡拜相。蕭遘與韋保衡雖是同科進(jìn)士，但卻素來(lái)不睦，因此被貶為播州司馬。

累職拜相

　　咸通十四年（873年），韋保衡獲罪賜死，蕭遘被征召回朝，擔(dān)任禮部員外郎，改任考功員外郎、知制誥。乾符元年（874年），蕭遘被任命為翰林學(xué)士、中書(shū)舍人，后累遷至戶(hù)部侍郎、翰林承旨。

　　廣明元年（880年），黃巢起義軍進(jìn)犯長(zhǎng)安。唐僖宗出逃，任命蕭遘為兵部侍郎、判度支，讓他掌握財(cái)賦。中和元年（881年），唐僖宗到達(dá)西川。蕭遘被任命為中書(shū)侍郎、同平章事，并兼任吏部尚書(shū)。

　　中和三年（883年），武寧節(jié)度使時(shí)溥中毒，懷疑是判官李凝古所為，因此將其殺死。李凝古的父親李損時(shí)任右散騎常侍，時(shí)溥便聲稱(chēng)李損與李凝古同謀。當(dāng)時(shí)，宦官田令孜收受時(shí)溥賄賂，便命御史臺(tái)審訊李損。蕭遘奏道：“李凝古投毒，本就事實(shí)不清，他父子離別數(shù)年，音訊不通，怎會(huì)是同謀？時(shí)溥恃功亂法，蔑視朝廷，欲殺天子近臣。如果依從他的要求，朝廷還怎么立足于天下！”李損因此免于一死。

　　光啟元年（885年），黃巢起義被平定。唐僖宗返回長(zhǎng)安，蕭遘被拜為司空，封楚國(guó)公。他自幼便志向遠(yuǎn)大，自負(fù)有王佐之才，拜相之后更是嚴(yán)肅端莊，因此深受皇帝器重。當(dāng)時(shí)，田令孜掌握禁軍，權(quán)勢(shì)熏天，公卿百官無(wú)不畏服，只有蕭遘不肯屈從。

招引朱玫

　　后來(lái)，田令孜與河中節(jié)度使王重榮爭(zhēng)奪鹽利，以朝廷名義改任王重榮為泰寧節(jié)度使。王重榮不聽(tīng)調(diào)令，并聯(lián)合河?xùn)|節(jié)度使李克用，在沙苑擊敗前來(lái)征討的朝廷禁軍，率軍直逼京師。唐僖宗大驚，逃往鳳翔。各鎮(zhèn)節(jié)度使紛紛上表，指責(zé)田令孜挑起事端，離間藩鎮(zhèn)。蕭遘素來(lái)憎惡田令孜，便與裴澈聯(lián)名致信給邠寧節(jié)度使朱玫，讓他率軍前來(lái)。

　　光啟二年（886年），朱玫率五千兵馬前往鳳翔迎駕，并與王重榮、李克用修好，要一同匡扶唐室。各藩鎮(zhèn)也相繼上表，請(qǐng)求皇帝返回長(zhǎng)安。田令孜卻脅迫僖宗前往陳倉(cāng)（今陜西寶雞），倉(cāng)促之下，百官都來(lái)不及隨從。不久，孔緯奉命返回鳳翔，召百官赴陳倉(cāng)。蕭遘因田令孜還在僖宗身邊，稱(chēng)病不肯前往。

　　不久，朱玫對(duì)蕭遘道：“主上六年來(lái)奔波流離，中原軍民與賊血戰(zhàn)，十死七八，這才收復(fù)京城。天下正為皇帝回京而高興，皇帝卻把平叛大功歸于田令孜，委以大權(quán)，致使朝綱法紀(jì)遭到踐踏，引出王重榮之亂。我前來(lái)勤王，不但沒(méi)有受到信任理解，反而成了脅迫君主，我們?cè)跄苁芑鹿俚臄[布。李氏子孫眾多，您為什么不另立皇帝，以匡扶社稷呢？”

　　蕭遘道：“皇帝繼位十幾年，沒(méi)有什么大錯(cuò)。田令孜擅攬大權(quán)，皇帝每次提及，都流涕不止。如今之事，皇帝本無(wú)意遷移，無(wú)奈被田令孜挾持而走。一切罪過(guò)都在田令孜身上，誰(shuí)人不知？你對(duì)皇室盡心效力，應(yīng)當(dāng)率軍回到鎮(zhèn)所，進(jìn)呈表章迎接皇上。廢立之事，連伊尹、霍光都曾感到為難，我蕭遘不敢遵命。”朱玫出去后，公開(kāi)宣告道：“我要擁立李氏王子為帝，敢反對(duì)者斬！”

貶官賜死

　　四月，朱玫立襄王李煴為帝，請(qǐng)蕭遘起草登基詔書(shū)。蕭遘推辭道：“我近來(lái)文思減退，還經(jīng)常讓人代筆，您還是請(qǐng)別人來(lái)寫(xiě)吧。”朱玫不悅，只得讓鄭昌圖草詔。五月，李煴返回長(zhǎng)安，將蕭遘罷為太子太保。蕭遘于是上表稱(chēng)病，退居河中永樂(lè)縣。

　　十二月，朱玫部將王行瑜倒戈，殺死朱玫，李熅逃往河中，也被王重榮斬殺。光啟三年（887年），唐僖宗返回長(zhǎng)安。宰相孔緯因與蕭遘不和，便以蕭遘曾接受李煴任命的官職為由，上奏朝廷將他貶官。不久，蕭遘又被賜死在永樂(lè)。