中游河谷保護區屬野生動物類型自然保護區，主要保護對象是國家一級保護動物—黑頸鶴及其越冬棲息地。本區有著較為完整的濕地生態系統，是黑頸鶴越冬的必要條件，因而具有極為重要的保護價值，同時，對于保護區區域內農耕等生存系統的調節和影響，也是濕地生態系統重要的價值所在。