博物館坐落在位于靈山山麓海拔850米處的一座生態科教園中。這就是北京靈山生態科教園，建于1997年，是具有民族特色的，有一定科學文化內涵的，有生態旅游功能的綠地。該園除了靈山西藏博物園外，還有另外的幾個部分：進行生態科研的北京靈山生態研究所；從事生態教育的中華愛國工程聯合會青少年生態教育基地和北京市團委青少年生態環保學校。靈山西藏博物園里坐落著別具特色的小木屋、小藏房和藏式帳篷，阡陌的引種試驗地中有一叢叢的高原樹木花草，還有即將建造的靈山生物多樣性標本館、生態電教中心以及華北山地樹木園等。博物園是一片生態旅游的綠色園地。古樹綠蔭、溪水潺潺、碧草山花，可以參觀游憩、讀書品茗，認識自然，享受自然，從而增強保護自然的使命與素養。博物園還是一座生態教育的園地。多種多樣的生態環保教育內容與形式，使青少年在課堂、在展室、在回歸自然享受自然的過程中學習、參與，寓教于樂，體現“愛我中華，愛我山河，保護地球，造福未來”的宗旨。除了這些，西藏博物園更是一個弘揚民族團結的園地。靈山——北京的“珠穆朗瑪”，亞高山草甸風光，與西藏高原“天生”的親緣相聯。園內藏式的建筑，展室中高原景觀與資源的圖片實物，以及人文風情展品等，輔以悠揚的藏族音樂，是西藏自然的“窗口”，首都與高原的綠色的紐帶。