醫院創建于1907年，前身是由沙俄在大連山城町（現勝利橋）建立的東清鐵道大連病院， 1907年，日本滿鐵株式會社在其基礎上建立了當時亞洲最大的醫院之一——滿鐵大連病院。2005年，醫院正式歸屬大連大學，更名為大連大學附屬中山醫院。醫院是一所集預防、醫療、教學、科研、康復為一體的綜合性大學附屬醫院。1992年在遼寧省首批晉升為國家三級甲等醫院。醫院承擔大連大學、大連醫科大學、遵義醫學院等院校包括博士、碩士研究生在內的5個層次、16個專業的教學任務。醫院注重學科建設，擁有國家級臨床重點專科1個(骨科)、省級臨床重點專科8個（骨科、腫瘤科、急診醫學科、康復科、肝膽外科、護理、介入科、醫學檢驗科）、大連市一級醫學重點專科10個（骨科、腫瘤科、急診醫學科、康復科、肝膽外科、血管外科、口腔科、呼吸科、心血管內科、護理），國家重點實驗室1個，遼寧省重點實驗室4個,大連市重點實驗室2個。擁有博士后工作站1個、院士工作站1個。2021年，醫院獲批大連市唯一一所中日醫療合作示范醫院；腫瘤科、骨科、肝膽外科、乳腺外科獲批大連市醫學重點學科“登峰計劃”建設項目。