公司是1998年經省政府批準由原省農墾農工商聯合總公司（前身為省農墾廳）改制成立的國有獨資公司，2004年納入省國資委管理序列，與安徽省農墾事業管理局系一個機構、兩塊牌子、一套班子，系經濟建設與社會事業同步發展的綜合性系統。農墾集團通過資產和資源整合，現有國有全資和控股企業30戶，其中農茶果場20個，主要分布在皖南4個、沿江2個、沿淮及淮北14個；全資和控股專業公司8戶。在產業結構上，沿淮農場以生產經營小麥和大豆為主，沿江農場以生產經營水稻、大豆為主，皖南茶場以生產經營茶葉和苗木為主，淮北碭山果園場以生產經營水果為主，農業產業化經營主要有種業、茶業、酒業、糧食加工業等。