1953年12月，淄博市衛生防疫站作為全省首批建立的10家衛生防疫站之一正式掛牌成立。按照國家疾病預防控制和衛生監督體制改革要求，2005年12月，淄博市疾病預防控制中心在原市衛生防疫站基礎上組建成立，是市衛生健康委所屬的全額撥款事業單位，主要承擔全市疾病預防與控制、突發公共衛生事件應急處置、疫情報告及健康相關因素信息管理、健康危害因素監測與干預、實驗室檢測評價與分析、健康教育與健康促進、技術管理與應用研究指導等工作任務。 中心加掛淄博市預防醫學研究院、淄博市健康教育所、淄博市衛生檢測檢驗中心牌子。2020年，山東大學淄博市疾病預防控制中心合作中心、濰坊醫學院附屬淄博市疾控中心揭牌成立。2021年，中心被確定為全省唯一一家地市級疾控改革試點單位。為全省首批通過CMA認證的檢驗檢測機構，具備國家實驗室認可資質、職業衛生技術服務機構資質、放射衛生技術服務機構資質（乙級）。中心緊緊圍繞“預防疾病發生，控制疾病流行，保障人民健康”的業務宗旨，堅持一切為了人民健康，認真貫徹落實“預防為主”的工作方針，多項工作走在全省乃至全國前列。